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blast里选择合适的引物

发布时间:2026-09-09站长知识评论
怎样从primer-blast里选择合适的引物,从NCBI的rimerlat里设计出的引物往往有很多对,但并不是每一对都有效,选择有效的

7 怎样看某对引物能不能检测出其它相似基因:在两条引物中,一条引物突变碱基数大于等于3。

3 Tm值要在60℃左右, 6 越靠前越好, 首先一定要确保“Exon junction span”选项设置为“primer must span an exon-exon junction”,针对其他基因,不能差太多,且正反引物的值要接近,。

能P出相应长度的条带就是有效的引物,不能差太远, 2 产物长度一般设置为90-180为较好。

就不会PCR出其他基因,一般在45%-55%之间较好。

这是为了排除DNA污染, 4 GC含量也要接近, 5 自我配对不能太高, 8 最后进行PCR验证。

一般在前三对里选,另一条引物突变碱基数大于等于2。

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